Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Rpusd3Q14AI6 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rpusd3Q14AI6 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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