Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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VdrP48281 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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VdrP48281 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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VdrP48281 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VdrP48281 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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