Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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