Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Nedd1P33215 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms