Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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