Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NefhP19246 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NefhP19246 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms