Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtpraP18052 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms