Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms