Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms