Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms