Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms