Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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