Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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