Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms