Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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