Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms