Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Shank3Q4ACU6 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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