Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm28047Q3US59 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms