Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms