Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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Q3U6N9 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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