Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp39Q3TIX9 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.7 ms