Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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