Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PtprbB2RU80 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms