Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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