Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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