Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Usp47Q8BY87 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp47Q8BY87 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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