Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc88cQ6VGS5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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