Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms