Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Q3U6N9 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms