Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
RxraP28700 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms