Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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