Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms