Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Spocd1B1ASB6 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Spocd1B1ASB6 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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Spocd1B1ASB6 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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