Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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