Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac6Q9Z2V5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms