Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms