Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ap3b1Q9Z1T1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.1 ms