Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf1Q9Z1B8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms