Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setbp1Q9Z180 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setbp1Q9Z180 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms