Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
NgfrQ9Z0W1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgfrQ9Z0W1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms