Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2l3Q9WTM4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2l3Q9WTM4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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