Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PplQ9R269 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PplQ9R269 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PplQ9R269 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PplQ9R269 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms