Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf7Q9R1C0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf7Q9R1C0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms