Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcm1Q9R0L6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcm1Q9R0L6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms