Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NrkQ9R0G8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NrkQ9R0G8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NrkQ9R0G8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms