Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamc3Q9R0B6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamc3Q9R0B6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms