Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek3Q9R0A5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nek3Q9R0A5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nek3Q9R0A5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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