Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms