Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clcf1Q9QZM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcf1Q9QZM3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms