Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc4Q9QZD4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ercc4Q9QZD4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms